Lek. Anna Pajkowska od 1999 roku jest specjalistką w dziedzinie pediatrii oraz posiada specjalizację z zakresu medycyny rodzinnej, którą uzyskała w 2004 roku.
Pracowała w Klinice Pneumonologii i Alergologii Wieku Dziecięcego w Samodzielnym Publicznym Dziecięcym Szpitalu Klinicznym w Warszawie, a także na Szpitalnym Oddziale Ratunkowym.
Na co dzień w swojej praktyce zawodowej diagnozuje i leczy bóle brzucha, kolki, infekcje dróg oddechowych oraz alergie. Zajmuje się edukacją w kwestii żywienia dzieci oraz doradza matkom karmiącym piersią.